138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1630 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0714  phosphodiesterase  77.86 
 
 
524 aa  853    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000321405  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1541  phosphodiesterase  78.24 
 
 
524 aa  811    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00592062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0928  phosphodiesterase  81.15 
 
 
525 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1632  phosphodiesterase  79.2 
 
 
524 aa  848    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1630  phosphodiesterase  100 
 
 
524 aa  1055    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00282322  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0818  phosphodiesterase  83.78 
 
 
524 aa  897    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2088  phosphodiesterase  80.53 
 
 
524 aa  859    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  44.23 
 
 
522 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.69 
 
 
517 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  41.62 
 
 
523 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  43.71 
 
 
536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  43.89 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  43.56 
 
 
519 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.27 
 
 
521 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  41.7 
 
 
521 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  40.61 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.61 
 
 
522 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  41.94 
 
 
513 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.19 
 
 
515 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  42.89 
 
 
520 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 
558 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  42.54 
 
 
511 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  43.27 
 
 
511 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
487 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  41.97 
 
 
519 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  42.86 
 
 
527 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  42.8 
 
 
511 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  41.92 
 
 
519 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  43.05 
 
 
512 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 
504 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 
524 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  42.12 
 
 
508 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  44.57 
 
 
513 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
513 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  43.18 
 
 
520 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  41.86 
 
 
520 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  43.67 
 
 
520 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  43.24 
 
 
515 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  41.26 
 
 
533 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  41.45 
 
 
533 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  44.23 
 
 
540 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
537 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  40.89 
 
 
519 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 
520 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 
513 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  41.79 
 
 
521 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  40.39 
 
 
518 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  40.84 
 
 
519 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  41.67 
 
 
518 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  40.89 
 
 
518 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
510 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  41.3 
 
 
521 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  40.73 
 
 
521 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  40.93 
 
 
521 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 
509 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.09 
 
 
509 aa  363  6e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 
514 aa  363  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  40.73 
 
 
520 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  41.38 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  41.92 
 
 
521 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  41.3 
 
 
521 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  40.93 
 
 
520 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  42.83 
 
 
502 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 
516 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.97 
 
 
512 aa  360  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
518 aa  360  4e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
517 aa  358  9e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  38.86 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  40.54 
 
 
510 aa  356  5e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 
523 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  40.92 
 
 
516 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  40.11 
 
 
517 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.78 
 
 
560 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  40.27 
 
 
518 aa  350  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  41.92 
 
 
520 aa  349  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 
525 aa  348  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.12 
 
 
530 aa  347  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  37.36 
 
 
535 aa  346  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  44.19 
 
 
501 aa  345  8e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  38.92 
 
 
546 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 
491 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  40.19 
 
 
535 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0875  phosphodiesterase  45.91 
 
 
575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  38.83 
 
 
532 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  36.97 
 
 
510 aa  343  5.999999999999999e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  40.19 
 
 
535 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  42.7 
 
 
510 aa  342  9e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.73 
 
 
487 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  41.23 
 
 
507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  42 
 
 
507 aa  340  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  40.04 
 
 
516 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  39.88 
 
 
531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  38.73 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  41.78 
 
 
480 aa  336  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.52 
 
 
527 aa  335  9e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>