143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06705 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  60.92 
 
 		 522 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  79.92 
 
 		 519 aa  837    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  60.19 
 
 		 517 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  63.42 
 
 		 536 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1051    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  76.63 
 
 		 522 aa  830    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  59.73 
 
 		 523 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  57.83 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  60.88 
 
 		 513 aa  612  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  58.44 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  47.39 
 
 		 521 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  48.43 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  46.04 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  45.86 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  48.57 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  46.59 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.9 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  46.74 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  46.39 
 
 		 521 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  48.08 
 
 		 521 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  46.74 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  44.98 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.68 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  44.3 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  44.27 
 
 		 520 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  44.91 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  43.05 
 
 		 518 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  47.2 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  47.17 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  43.73 
 
 		 519 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  45.56 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  44.44 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.73 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  43.53 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  43.71 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  45.13 
 
 		 511 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  45.96 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  44.34 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  44.97 
 
 		 516 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  45.21 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  42.63 
 
 		 525 aa  438  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  40.08 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  44.49 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  44.83 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.03 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.81 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  42.05 
 
 		 540 aa  428  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  44.65 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  44.11 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  44.25 
 
 		 518 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.53 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  49.52 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  43.92 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  43.73 
 
 		 520 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  44.72 
 
 		 518 aa  420  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  42.72 
 
 		 521 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  42.91 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  43.88 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.88 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 		 518 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  42.53 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  45.82 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  42.75 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  42.55 
 
 		 535 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.29 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0818  phosphodiesterase  41.93 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  43.32 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.52 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0928  phosphodiesterase  40.23 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  42.09 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1632  phosphodiesterase  41.8 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  40.3 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0714  phosphodiesterase  41.18 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000321405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  42.94 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  42.09 
 
 		 519 aa  402  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  42.32 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1630  phosphodiesterase  40.61 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00282322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2088  phosphodiesterase  41.94 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1541  phosphodiesterase  42.8 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00592062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  40.27 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  44.78 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  40.08 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  42.09 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  39.89 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.09 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  44.47 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>