150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3293 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  79.96 
 
 		 520 aa  841    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  64.98 
 
 		 520 aa  691    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  80.15 
 
 		 520 aa  837    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  100 
 
 		 533 aa  1063    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  61.97 
 
 		 520 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  73.73 
 
 		 521 aa  778    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  82.18 
 
 		 521 aa  866    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  74.76 
 
 		 521 aa  763    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  99.25 
 
 		 533 aa  1058    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  59.03 
 
 		 520 aa  608  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  56.17 
 
 		 519 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  56.36 
 
 		 519 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  56.36 
 
 		 527 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  56.38 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  56.19 
 
 		 518 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  55.85 
 
 		 519 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  54.29 
 
 		 512 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  55.16 
 
 		 487 aa  571  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.44 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  54.48 
 
 		 508 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  52.47 
 
 		 511 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  54.49 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  54.3 
 
 		 511 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  54.17 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  52.84 
 
 		 520 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  52.84 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.98 
 
 		 522 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  52.84 
 
 		 520 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  52.91 
 
 		 521 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  52.65 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  52.65 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  52.65 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  52.65 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  52.94 
 
 		 521 aa  545  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  48.96 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  52.27 
 
 		 521 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  53.24 
 
 		 514 aa  539  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  53.9 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  52.65 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  52.16 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  52.95 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  53.33 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.48 
 
 		 510 aa  535  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  54.65 
 
 		 516 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  50.84 
 
 		 515 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  53.92 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.12 
 
 		 516 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.87 
 
 		 518 aa  521  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  51.21 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.69 
 
 		 509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  53.11 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  51.01 
 
 		 525 aa  511  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  50.75 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  48.87 
 
 		 517 aa  510  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  51.28 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  54.4 
 
 		 520 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  58.39 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  49.9 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  47.65 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  53.6 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  53.6 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  47.45 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  54.87 
 
 		 519 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  47.91 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  48.5 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  48.07 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  46.04 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.61 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  46 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  48.06 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 		 558 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  47.73 
 
 		 536 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  47.56 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  47.74 
 
 		 527 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  48.13 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  46.42 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  54.19 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  47.52 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  45.87 
 
 		 535 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  45.94 
 
 		 540 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  51.24 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.35 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  48.86 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  54.08 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  45.54 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.61 
 
 		 487 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  51.12 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.97 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  52.1 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  47.18 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  45.21 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.33 
 
 		 588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  53.35 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  45.98 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  51.63 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1681  phosphodiesterase  52.08 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  49.05 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>