154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1180 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  89.23 
 
 		 520 aa  913    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  66.92 
 
 		 520 aa  709    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  100 
 
 		 520 aa  1030    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  65.68 
 
 		 520 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  77.74 
 
 		 521 aa  812    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  82.92 
 
 		 521 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  80.15 
 
 		 533 aa  858    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  77.6 
 
 		 521 aa  780    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  80.34 
 
 		 533 aa  861    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  59.34 
 
 		 519 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  58.32 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  59.92 
 
 		 520 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  58.14 
 
 		 527 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  57.56 
 
 		 519 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  56.78 
 
 		 518 aa  594  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  56.2 
 
 		 519 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  56.92 
 
 		 512 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  56.59 
 
 		 487 aa  583  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  57 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  55.09 
 
 		 521 aa  578  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  58.37 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  56.61 
 
 		 508 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  58.17 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  55.94 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  56.31 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  55.73 
 
 		 524 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  55 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  55.43 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  55 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  55.64 
 
 		 521 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  55.19 
 
 		 520 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  55.64 
 
 		 518 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  55.04 
 
 		 521 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  56.24 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  55.84 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 		 513 aa  541  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  54.37 
 
 		 515 aa  545  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  55.75 
 
 		 514 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  53.09 
 
 		 515 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.46 
 
 		 510 aa  537  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.74 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  57.27 
 
 		 535 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  55.64 
 
 		 504 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.68 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  56.69 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.22 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  56.4 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  52.91 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  54.15 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  51.93 
 
 		 525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  53.97 
 
 		 520 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  47.87 
 
 		 523 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  55.23 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  53.59 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  51.49 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  53.59 
 
 		 519 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  55.35 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  48.45 
 
 		 517 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  49.03 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  51.27 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.49 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  48.84 
 
 		 522 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  48.73 
 
 		 509 aa  488  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  48.7 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  48.85 
 
 		 527 aa  485  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  50 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  46.74 
 
 		 522 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  48.27 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  48.31 
 
 		 519 aa  481  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  48.46 
 
 		 527 aa  482  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  53.85 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  46.65 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.47 
 
 		 487 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  50.61 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  48.85 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.42 
 
 		 530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  50.31 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  50.1 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.24 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.31 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  49.9 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  51.43 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  52.28 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  55.48 
 
 		 491 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.51 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  46.88 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  45 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  54.61 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  52.69 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  49.49 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  50.58 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  46.8 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.69 
 
 		 588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  50.57 
 
 		 507 aa  445  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0859  metal dependent phosphohydrolase  49.37 
 
 		 587 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>