140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1632 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0714  phosphodiesterase  84.16 
 
 		 524 aa  927    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000321405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1541  phosphodiesterase  84.16 
 
 		 524 aa  882    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00592062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0928  phosphodiesterase  88.19 
 
 		 525 aa  952    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1632  phosphodiesterase  100 
 
 		 524 aa  1054    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1630  phosphodiesterase  79.2 
 
 		 524 aa  874    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00282322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0818  phosphodiesterase  80.53 
 
 		 524 aa  880    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2088  phosphodiesterase  87.21 
 
 		 524 aa  931    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  43.63 
 
 		 521 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  43.1 
 
 		 523 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.03 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  43.27 
 
 		 522 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  45.91 
 
 		 536 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  40.8 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.87 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  42.59 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.54 
 
 		 522 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.8 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  44.49 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  43.46 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  41.67 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  41.24 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  42.97 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.91 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  41.15 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  41.15 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  45.47 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  41.92 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  41.55 
 
 		 527 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 		 520 aa  389  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  43.41 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  42.88 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.98 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  41.57 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  41.76 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  41.89 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  44.51 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  39.7 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  41.51 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  40.5 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  40.79 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  41.47 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  40.69 
 
 		 519 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  40.15 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  40.73 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  40.04 
 
 		 518 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.51 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  43.5 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  42.54 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  39.63 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  41.25 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.05 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  41.73 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 517 aa  363  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  40.08 
 
 		 518 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.86 
 
 		 560 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  40.72 
 
 		 518 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  39.27 
 
 		 510 aa  359  6e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  44.74 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  44.8 
 
 		 491 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  38.61 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  42.18 
 
 		 518 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 530 aa  355  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  41.65 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  39.2 
 
 		 521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  44.06 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  44.34 
 
 		 501 aa  353  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  39.59 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  39.7 
 
 		 521 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  39.29 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  39.4 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  39.85 
 
 		 521 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  39.12 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.83 
 
 		 527 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  39.24 
 
 		 535 aa  350  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  43.09 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  40.08 
 
 		 507 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  40.27 
 
 		 507 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  40.28 
 
 		 519 aa  343  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.99 
 
 		 487 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.81 
 
 		 509 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  43.45 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  36.62 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  39.47 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  40.08 
 
 		 519 aa  340  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>