More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03090 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03090  two-component response regulator, putative  100 
 
 
1352 aa  2729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07697  cytoplasmic response regulator (Eurofung)  61.8 
 
 
838 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567712  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32546  predicted protein  53 
 
 
749 aa  213  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.035619  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
893 aa  99.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
781 aa  94  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.16 
 
 
645 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
902 aa  91.7  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.98 
 
 
738 aa  91.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  34.64 
 
 
641 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.5 
 
 
852 aa  90.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.67 
 
 
582 aa  90.9  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  32.36 
 
 
1243 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.44 
 
 
1922 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
916 aa  90.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
957 aa  90.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1266 aa  89.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
633 aa  89  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.14 
 
 
853 aa  88.6  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1027 aa  88.2  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
844 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
995 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
1033 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
778 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
643 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  34.01 
 
 
735 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
844 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1271 aa  87  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
643 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1064 aa  87.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.81 
 
 
858 aa  87  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
1548 aa  87.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1223 aa  87  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.11 
 
 
1763 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
782 aa  86.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1005 aa  86.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
592 aa  86.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
667 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
643 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
1313 aa  86.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
721 aa  86.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1407 aa  86.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1363 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
827 aa  85.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
882 aa  85.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
968 aa  85.5  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.93 
 
 
1683 aa  85.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
817 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  35.56 
 
 
1060 aa  85.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
947 aa  85.1  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
738 aa  85.1  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
1768 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.01 
 
 
2213 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  32.26 
 
 
676 aa  85.1  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03400  two-component sensor molecule, putative  37.75 
 
 
1617 aa  85.1  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.64378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
631 aa  85.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
945 aa  85.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0642  sensor histidine kinase/response regulator  34.07 
 
 
1385 aa  84.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
643 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1275 aa  84.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
962 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
1002 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1143 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
921 aa  84.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1251 aa  84.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
1002 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04113  conserved hypothetical protein  37.86 
 
 
1205 aa  83.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
1765 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.62 
 
 
651 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  33.54 
 
 
550 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  34.25 
 
 
671 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
764 aa  84  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1202 aa  83.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1322 aa  83.2  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  34.21 
 
 
666 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
846 aa  83.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
974 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  33.11 
 
 
1030 aa  83.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  32.19 
 
 
691 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.69 
 
 
1560 aa  82.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
1313 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
801 aa  82.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06820  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00660)  32.41 
 
 
1212 aa  82.8  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.82 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
914 aa  82.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1172 aa  82.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3343  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
800 aa  82.4  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.339102  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  34.75 
 
 
2312 aa  82.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.1 
 
 
772 aa  82  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  34.93 
 
 
651 aa  82  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
898 aa  81.6  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
690 aa  82  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.16 
 
 
948 aa  81.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.88 
 
 
794 aa  81.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.37 
 
 
977 aa  81.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
911 aa  81.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.45 
 
 
982 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
1066 aa  81.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
818 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>