85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0518 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  59.86 
 
 		 286 aa  324  9e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  57.91 
 
 		 283 aa  316  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  55.67 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  47.5 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  46.43 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  46.07 
 
 		 291 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  45.39 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  40.45 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  40.77 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  39.65 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.42 
 
 		 320 aa  201  9e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  40.48 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  39.18 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  38.16 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  37.71 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  37.59 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  41.15 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  39.64 
 
 		 283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  35.64 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  35.64 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  34.24 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  34.27 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  34.27 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  33.96 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  34.27 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  33.96 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  35.64 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  24.65 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.57 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  25.78 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  22.71 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  25.26 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  30.14 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  22.87 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.74 
 
 		 287 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  38.46 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  34.09 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  26.53 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.51 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  27.03 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  23.51 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  34.55 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.1 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  23.08 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  26.37 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  26.42 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  39.06 
 
 		 327 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 312 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.88 
 
 		 338 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  28 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  34.83 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  25.86 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.62 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.88 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.5 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.88 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.88 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  24.56 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.89 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.81 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  32.94 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  25.14 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  24.21 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.33 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  35.48 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  33.73 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.42 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  23.83 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  22.99 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0767  D-cysteine desulfhydrase  32.26 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0197666  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  23.57 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.19 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.53 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.91 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>