69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2680 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  68.85 
 
 		 305 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  60.97 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  60.33 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  60.98 
 
 		 311 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  59.55 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  60.13 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  55.42 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  59.08 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  55.89 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  56.19 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  55.72 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  55.72 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  55.16 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  47.62 
 
 		 339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  46.58 
 
 		 341 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  48.37 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  46.39 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.9 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  44.59 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.86 
 
 		 283 aa  219  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.37 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  37.59 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.84 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  36.51 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  31.44 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.81 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  26.39 
 
 		 428 aa  93.2  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  26.25 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  25.5 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.92 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  26.03 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.68 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.87 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  55.81 
 
 		 47 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.34 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  23.34 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  27.37 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  27.37 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.19 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  24.14 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.28 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  25.57 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  23.22 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  24.64 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  25.14 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  25.52 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  24.74 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  22.77 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  22.27 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.22 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  23.14 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  22.77 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.73 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  26.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  26.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  26.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  26.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  23.14 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  26.86 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.97 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  23.14 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  24.26 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>