85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2321 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  51.87 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  51.38 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  51.38 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  51.08 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  49.71 
 
 		 334 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  48.99 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  48.84 
 
 		 348 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  51.27 
 
 		 311 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  50.78 
 
 		 305 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  48.4 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  49.84 
 
 		 307 aa  318  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  49.53 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  48.75 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  46.23 
 
 		 306 aa  271  9e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  40.99 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.38 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  39.81 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  40.31 
 
 		 341 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  41.12 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.45 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.45 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  40.45 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.49 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  35.51 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  35.51 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  35.2 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  29.11 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  29.69 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  25.75 
 
 		 428 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  24.52 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  30.81 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.61 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0858  hypothetical protein  24.05 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000626583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.43 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.7 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  24.38 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  24.38 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  24.38 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  23.97 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  27.05 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  24.76 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  27.47 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  26.97 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  23.4 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.32 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  46.51 
 
 		 47 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  24.56 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  25.08 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  25.36 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  25.91 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  25.91 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  21.51 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  25.82 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  26.45 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  26.95 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  23.7 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  25.38 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  21.51 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  24.75 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  25.39 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  25.41 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  24.86 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  25.13 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  25.45 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  23.72 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  22.56 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  36.92 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  27.38 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  36.92 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  27.38 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  27.38 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  27.38 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  27.38 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  25.28 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  36.92 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  26.09 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  21.93 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.1518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>