71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0703 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  99.31 
 
 
291 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  96.91 
 
 
291 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  45.67 
 
 
288 aa  250  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  46.07 
 
 
290 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.88 
 
 
283 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.97 
 
 
286 aa  219  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  39.1 
 
 
292 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  40.73 
 
 
305 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  36.67 
 
 
308 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  37.46 
 
 
325 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  36.22 
 
 
330 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  37.13 
 
 
325 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  38.78 
 
 
341 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  39 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  36.07 
 
 
311 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  35.51 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  36.84 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  37.76 
 
 
283 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  37.88 
 
 
298 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  36.54 
 
 
305 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.96 
 
 
320 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  33.54 
 
 
348 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  33.85 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  33.73 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  32.62 
 
 
334 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  32.63 
 
 
334 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  32.33 
 
 
339 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  32.79 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  34.48 
 
 
350 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  27.76 
 
 
428 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  29.38 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  27.86 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.52 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  28.26 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  30.27 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.51 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  31.46 
 
 
299 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  30.34 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  27.86 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  26.15 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  29.48 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.43 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.93 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  24.24 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  42.37 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  28.57 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  26.83 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  26.7 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  29.44 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.08 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0858  hypothetical protein  30.22 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000626583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  29.44 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  28.57 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  30 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  25.65 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  23.91 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  23.91 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  23.91 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  23.91 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  20.97 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  26.77 
 
 
332 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>