73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003059 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 		 320 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  80.54 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  62.63 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  59.02 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  46.6 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  46.56 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  46.93 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  45.95 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  45.9 
 
 		 307 aa  255  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  46.15 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  44.67 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  41.99 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  41.38 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  41.09 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  40.18 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  41.06 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  40.18 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  45.27 
 
 		 292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  39.88 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  42.64 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  42.52 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  40.42 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.16 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  38.91 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.74 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  36.64 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  35.96 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  35.96 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  36.19 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  29.66 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.87 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.56 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.77 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  22.14 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  23.75 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  23.67 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  23.75 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.05 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.04 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.52 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.61 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6027  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.68 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  27.12 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  24.36 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.95 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  28.06 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  26.51 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  28.24 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  28.24 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2314  D-cysteine desulfhydrase  28.49 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  29.55 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  26.4 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  27.59 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  27.17 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  27.33 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  43.9 
 
 		 47 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  26.4 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  28.07 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  26.74 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  32.26 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  25.76 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  24.29 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  28.16 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>