45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0110 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  74.46 
 
 
283 aa  428  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  59.86 
 
 
290 aa  324  9e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  58.48 
 
 
288 aa  316  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  48.36 
 
 
292 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  40.92 
 
 
330 aa  221  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  43.97 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  43.97 
 
 
291 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  43.97 
 
 
291 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  40.46 
 
 
311 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  40.83 
 
 
305 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  40.45 
 
 
323 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  42.52 
 
 
320 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  37.73 
 
 
342 aa  205  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  39.53 
 
 
305 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  41.84 
 
 
341 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  39.86 
 
 
308 aa  198  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  35.58 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  36 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  36.31 
 
 
334 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  40.61 
 
 
298 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  35.69 
 
 
348 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  37.37 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  39.86 
 
 
306 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  34.94 
 
 
339 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  36.12 
 
 
307 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  36.33 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  36.03 
 
 
350 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  25.43 
 
 
428 aa  75.5  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  25.85 
 
 
331 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  25.85 
 
 
331 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  30 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  29.41 
 
 
331 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  29.41 
 
 
331 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  29.41 
 
 
331 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  29.75 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  29.41 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  29.41 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  28.71 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  29.75 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.38 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  39.71 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  33.83 
 
 
345 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>