102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2073 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 		 283 aa  579  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  74.46 
 
 		 286 aa  428  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  57.91 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  58.48 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  47.12 
 
 		 292 aa  241  9e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  44.88 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  44.88 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  44.88 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  39.86 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  42.43 
 
 		 325 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  42.43 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  40.74 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  41.84 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  38.77 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  37.85 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  40.68 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  39.08 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  40.45 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  40.4 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  38.04 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  38.15 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  37.35 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  38.06 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.16 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  35.96 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  38.08 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  36.93 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  35.8 
 
 		 350 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  35.56 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  26.09 
 
 		 428 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  25.99 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  28.42 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  31.32 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  30.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1412  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.04 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  29.59 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  30.59 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  27.32 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1216  D-cysteine desulfhydrase, putative  23.49 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  26.95 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  24.42 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  30.06 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  26.53 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  26.49 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  31.17 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.85 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.04 
 
 		 342 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.93 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  31.74 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3675  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.51 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  30.22 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  28.07 
 
 		 343 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  24.17 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3877  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.49 
 
 		 356 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  30.12 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  29.76 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  25.43 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.98 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  32.26 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.49 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.89 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.93 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.39 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  26.74 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.27 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.39 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.39 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.92 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  30 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.49 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.21 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05576  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.21 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.21 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  30.99 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.3 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  27.11 
 
 		 365 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.85 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0952  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  24.62 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1385  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0995718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.92 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  28.57 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5099  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.49 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  27.34 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  25.14 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2004  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.85 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.876567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>