63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1882 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  634    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  59.81 
 
 		 330 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  59.74 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  59.08 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  53.89 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  59.34 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  56.91 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  57.1 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  52.27 
 
 		 334 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  52.41 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  55.95 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  52.27 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  52.41 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  48.75 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  45.7 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  51.15 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  47.06 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  43.05 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  40.98 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.06 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  41.06 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.4 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.53 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  40.73 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  40.73 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  40.07 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  37.71 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.7 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.45 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  88.64 
 
 		 47 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  25.5 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  24.16 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  26.5 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.67 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.25 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.57 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.47 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  25.65 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  24.07 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  27.59 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  23.37 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  27.22 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  27.59 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  27.41 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.69 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0858  hypothetical protein  22.71 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000626583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  26.43 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  23.7 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  28.02 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  33.33 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  23.38 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  25.91 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.98 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  23.38 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  23.38 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  23.7 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  24.68 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  23.7 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  23.38 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.66 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.86 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>