34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2652 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  100 
 
 
350 aa  722    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  41.15 
 
 
290 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.8 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  38.46 
 
 
292 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.03 
 
 
286 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  37.28 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33.58 
 
 
288 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  35.63 
 
 
291 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  35.14 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.19 
 
 
320 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  34.48 
 
 
291 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  34.87 
 
 
291 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  33.81 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  33.45 
 
 
305 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  35.77 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  32.75 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  33.22 
 
 
325 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  33.8 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  31.77 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  31.72 
 
 
339 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  32.75 
 
 
311 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  31.27 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  33.85 
 
 
283 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  28.16 
 
 
342 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  28.34 
 
 
334 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  31.12 
 
 
307 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  28.01 
 
 
334 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  28.34 
 
 
348 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  28.01 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  26.51 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.65 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.05 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.3 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>