88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1217 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  58.48 
 
 		 286 aa  316  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  55.67 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  58.48 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  45.67 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  44.98 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  43.54 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  38.49 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  35.53 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  36.96 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  36.18 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.74 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  37.84 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  39.79 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  35.74 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  35.42 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  37.72 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  34.69 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  34.23 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  35.11 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  36.7 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  34.8 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  33.54 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  34.86 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  34.71 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.58 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  31.38 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  25.43 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  22.65 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  24.26 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  25.35 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  23.95 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  26.44 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.24 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  21.24 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  24.35 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  26.1 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  26.1 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  26.1 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  26.1 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  26.1 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  23.39 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  26.83 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  25.69 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  25.69 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  26.1 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  27.84 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  22.98 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  28.26 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  19.67 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  34.94 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  23.86 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  23.86 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  23.86 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  20.61 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.78 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  23.47 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  22.18 
 
 		 331 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  28.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.97 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  26.4 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.88 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  24.74 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.61 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  27.78 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  22.3 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.14 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  24.44 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1216  D-cysteine desulfhydrase, putative  22.09 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.39 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.15 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  22.53 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  21.5 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.64 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.64 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.64 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>