83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1941 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  68.85 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  59.34 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  60 
 
 		 311 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  59.03 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  59.03 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  60.97 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  56.02 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  55.89 
 
 		 334 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  59.74 
 
 		 305 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  55.89 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  55.72 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  55.42 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  50.78 
 
 		 323 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  47.92 
 
 		 339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  51.61 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  51.16 
 
 		 307 aa  295  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  46.6 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  46.56 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  45.63 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  45.7 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.74 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.83 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  39.18 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.5 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  37.21 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  36.54 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  36.54 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  33.67 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  31.77 
 
 		 350 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  25.7 
 
 		 428 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  24.83 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  24.48 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.42 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.16 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  26.96 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.44 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  26.05 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.16 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  20.68 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  51.16 
 
 		 47 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  24.09 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  24.09 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.92 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  24.77 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  24.77 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  25.23 
 
 		 331 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  28.19 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  22.74 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  25.55 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  27.27 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  26.16 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  24.38 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  24.32 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  27.18 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  24.06 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0953  putative D-cysteine desulfhydrase, DcyD  25.77 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  23.72 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  26.32 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  26.32 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  23.41 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  43.86 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1216  D-cysteine desulfhydrase, putative  23.44 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  27.42 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  37.33 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  37.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  22.26 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  37.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  37.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  37.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  27.42 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  24.4 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  38.57 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  37.33 
 
 		 328 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  27.42 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  31.33 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  24.4 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  25 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.1518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>