180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5179 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  100 
 
 		 332 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  96.99 
 
 		 332 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  81.65 
 
 		 334 aa  544  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  69.39 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  65.65 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  65.65 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  65.65 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  65.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  65.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  65.35 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  65.35 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  66.67 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  60.24 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  60.24 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  60.24 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  60.24 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  59.94 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  58.72 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  58.72 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  58.72 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  58.72 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  58.72 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  57.96 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  59.02 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  59.94 
 
 		 361 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  48.06 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  47.16 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  45.29 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  42.04 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  42.47 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  42.77 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  42.77 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  41.57 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  42.6 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  42.77 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  42.77 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  46.3 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  42.17 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  41.74 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  42.04 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  45.81 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  41.92 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  42.55 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  41.57 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  42.55 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  44.27 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  45.07 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.41 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  42.99 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.98 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.62 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  44.74 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  45.9 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.48 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.95 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.95 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  42.81 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.65 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.92 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.41 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.79 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  41.92 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.1 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.22 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2314  D-cysteine desulfhydrase  40.84 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.92 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.1 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.89 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  41.27 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0952  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114665  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1385  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0995718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.92 
 
 		 342 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.87 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.35 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3675  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.87 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  44.41 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.05 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.62 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.21 
 
 		 338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5856  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.72 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0688511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.57 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.64 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  39.39 
 
 		 359 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1521  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.24 
 
 		 336 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3877  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.02 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2004  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.05 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.876567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.02 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.02 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.72 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.43 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  40.48 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_003296  RS05576  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.02 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  0.322563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>