101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0518 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.91 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  39.64 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.79 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  37.2 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  37.72 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  37.72 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  37.76 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  36.18 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.33 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  37.06 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  33.67 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.56 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  34.55 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  32.22 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  31.44 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  31.49 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  31.17 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  29.11 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  31.29 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  31.05 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  28.48 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  27.88 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  28.18 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  28.48 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  27.58 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  30.14 
 
 		 428 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.85 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  27.87 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.01 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.35 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  26.9 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  25 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  26.67 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  26.49 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.44 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  26.53 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  29.24 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.57 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  26.79 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.26 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.36 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  23.86 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.46 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  30.22 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  24.52 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  24.52 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  24.52 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  24.52 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  24.84 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  24.84 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  23.89 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  27.11 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.85 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  28.04 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  28.04 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  23.36 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  23.87 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  23.87 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  23.3 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  28.34 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  21.45 
 
 		 333 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  27.14 
 
 		 337 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  22.87 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  22.95 
 
 		 339 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  34.41 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.14 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  22.95 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  27.7 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  27.33 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  24.32 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  24.49 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  26.35 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  23.99 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  23.99 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  26.95 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  23.99 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  23.99 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  24 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  45.9 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  30.68 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  28.49 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  24 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  22.26 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  26.95 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.99 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00640  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  25.98 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>