60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02795 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  627  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  80.54 
 
 
320 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  59.6 
 
 
341 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  58.69 
 
 
306 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  47.21 
 
 
308 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  46.56 
 
 
305 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  43.05 
 
 
305 aa  258  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  46.82 
 
 
307 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  45.31 
 
 
325 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  45.63 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  44.59 
 
 
307 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  44.34 
 
 
330 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  43.33 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  39.81 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  40.79 
 
 
342 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  45.61 
 
 
292 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  41.02 
 
 
334 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  40.12 
 
 
334 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  40.42 
 
 
348 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  40.12 
 
 
334 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  40.67 
 
 
339 aa  235  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  40.77 
 
 
290 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.61 
 
 
286 aa  196  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.08 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  37.2 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  37.88 
 
 
291 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  37.54 
 
 
291 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  37.54 
 
 
291 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  34.86 
 
 
288 aa  165  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  35.14 
 
 
350 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  27.07 
 
 
428 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.53 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.35 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.74 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  24.05 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  24.05 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  24.08 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  21.96 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.17 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.59 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.57 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  23.55 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  25.26 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.79 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  24.75 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.74 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  21.19 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  25.98 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.15 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  28.49 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  43.9 
 
 
47 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  28.65 
 
 
335 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  30.23 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.27 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  28.07 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  23.43 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  23.43 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  31.25 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  28.8 
 
 
334 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  28.26 
 
 
331 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>