69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1068 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  97.59 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  96.91 
 
 
291 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.98 
 
 
288 aa  249  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  47.5 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  44.88 
 
 
283 aa  225  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.97 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  38.75 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  40.07 
 
 
305 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  38.11 
 
 
325 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  37 
 
 
308 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  37.79 
 
 
325 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  36.3 
 
 
330 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  40.14 
 
 
341 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  39 
 
 
306 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  36.72 
 
 
311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  36.84 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  35.2 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  37.72 
 
 
283 aa  171  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  37.21 
 
 
305 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.64 
 
 
320 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  37.54 
 
 
298 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  33.84 
 
 
348 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  34.15 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  33.84 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  32.83 
 
 
334 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  32.93 
 
 
334 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  32.63 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  32.13 
 
 
307 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  35.63 
 
 
350 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  27.25 
 
 
428 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  28.36 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  29.9 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  28.57 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.18 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  30.81 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.86 
 
 
311 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  28.36 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  31.46 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  30.06 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  30.34 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  44.07 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  26.15 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  24.24 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.88 
 
 
339 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  29.26 
 
 
342 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40 
 
 
290 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  28.57 
 
 
327 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  26.83 
 
 
342 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  30 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  30 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  24.38 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  20.9 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.1 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  27.27 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  24.53 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  24.53 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  25.41 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  24.53 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  24.53 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>