88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2351 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  97.54 
 
 		 325 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  86.93 
 
 		 311 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  84.35 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  66.87 
 
 		 342 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  67.98 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  67.17 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  67.07 
 
 		 334 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  66.47 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  59.03 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  59.55 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  56.13 
 
 		 308 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  55.95 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  51.08 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  48.21 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  50.49 
 
 		 306 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  46.96 
 
 		 307 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  45.83 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  46.13 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  44.34 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  45.63 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  41.25 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  42.43 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  38.11 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  37.46 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  37.46 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.96 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  36.3 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  31.49 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  33.22 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  24.86 
 
 		 428 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  25.25 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.3 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  25.44 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.52 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.55 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.75 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1883  hypothetical protein  55.81 
 
 		 47 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  23.92 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.57 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.45 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  27.68 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  27.68 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  24.15 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  24.52 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  25.88 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.74 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  23.81 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  24.18 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  25.37 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  23.49 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  34.94 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2314  D-cysteine desulfhydrase  27.12 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  24.3 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  32.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  33.04 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.76 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  31 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.19 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  23.17 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  34.57 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  34.57 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  34.57 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  34.57 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  34.57 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  27.78 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  28.43 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  31.17 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  27.78 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  27.78 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  24.3 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0858  hypothetical protein  25.7 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000626583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  29.11 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  20.62 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  23.96 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>