More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09853 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09853  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  100 
 
 
445 aa  913    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2487  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.9 
 
 
446 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.89 
 
 
446 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0330231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.44 
 
 
447 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.86 
 
 
450 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1006  ATP-dependent RNA helicase  40.28 
 
 
463 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.456237  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.75 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3228  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.86 
 
 
444 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157836  normal  0.116835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5691  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.62 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.2 
 
 
629 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
628 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 
452 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.29 
 
 
479 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.19 
 
 
463 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  39.28 
 
 
629 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.1 
 
 
535 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  39.57 
 
 
460 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 
489 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.84 
 
 
459 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.74 
 
 
497 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  36.38 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.59 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  38.88 
 
 
622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.37 
 
 
507 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.2 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.27 
 
 
510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.27 
 
 
510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.3 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.54 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  41.3 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.3 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.32 
 
 
499 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  38.56 
 
 
477 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 
549 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
526 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.4 
 
 
488 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.308485  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
525 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 
471 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 
626 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.55 
 
 
578 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.6 
 
 
487 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
525 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 
453 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.52 
 
 
477 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.93 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.55 
 
 
549 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.2 
 
 
454 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.2 
 
 
455 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  38.93 
 
 
398 aa  280  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.47 
 
 
418 aa  280  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.05 
 
 
515 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.73 
 
 
415 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
492 aa  280  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.1 
 
 
441 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  40.59 
 
 
393 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.4 
 
 
494 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.27 
 
 
506 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
437 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.82 
 
 
429 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.19 
 
 
513 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38 
 
 
626 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  36.49 
 
 
424 aa  279  9e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.63 
 
 
476 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.2 
 
 
452 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
463 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38 
 
 
627 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  37.88 
 
 
498 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.5 
 
 
491 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  41.96 
 
 
507 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.93 
 
 
454 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
443 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 
550 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.04 
 
 
436 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
453 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.16 
 
 
540 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.25 
 
 
630 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.96 
 
 
507 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
453 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
453 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  38.05 
 
 
516 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.1 
 
 
418 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
453 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.87 
 
 
453 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.67 
 
 
533 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  41.67 
 
 
527 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.65 
 
 
471 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  35.65 
 
 
639 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  40.66 
 
 
495 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  36.66 
 
 
557 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7154  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.64 
 
 
479 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.557352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  39.25 
 
 
446 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.22 
 
 
479 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.42 
 
 
447 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.73 
 
 
456 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>