More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0320 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  45.63 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  45.63 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  45.63 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 866 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  43.69 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  40 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  40 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.43 
 
 		 2031 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 657 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0713  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 526 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 529 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 938 aa  72  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 776 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  40 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.03 
 
 		 382 aa  71.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 660 aa  70.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 917 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.09 
 
 		 1233 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 657 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 761 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4393  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  31.62 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1088 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 761 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 528 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2462  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3484  response regulator receiver protein  35 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180993  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 530 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 807 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1261 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 530 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2453  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2287  response regulator receiver protein  35 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  normal  0.814678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 641 aa  67.4  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  34.78 
 
 		 554 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 906 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  40.68 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  38.18 
 
 		 714 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.9 
 
 		 1152 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.19 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  35.57 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.2 
 
 		 1535 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4732  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.539442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.38 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  37.17 
 
 		 547 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1352 aa  64.7  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.38 
 
 		 1303 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1344 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 835 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.48 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  36.52 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 989 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1970  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1977 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  32.79 
 
 		 459 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  34.59 
 
 		 551 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6875  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 129 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001593  putative two-component response regulator  33.64 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000660606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.93 
 
 		 1015 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  34.55 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1223 aa  61.6  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 458 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 1287 aa  60.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 633 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1406 aa  60.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  34.88 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  34.15 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 639 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  37.86 
 
 		 554 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>