More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3992 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  100 
 
 		 157 aa  319  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  44 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  43.36 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  43.36 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  43.36 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  42.72 
 
 		 547 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  38.98 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 657 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1261 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 764 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 664 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.15 
 
 		 1218 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 906 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 866 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 917 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1185 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  32.23 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  43.27 
 
 		 554 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.06 
 
 		 2468 aa  79  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 945 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0713  response regulator receiver domain-containing protein  36.3 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.454574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  29.86 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 776 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4393  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 657 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  39.81 
 
 		 714 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1287 aa  77.4  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 846 aa  77.4  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1088 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 935 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1287 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 702 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 776 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.81 
 
 		 1233 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  32.48 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1977 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4781  response regulator receiver protein  34 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73464  normal  0.808213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 721 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1352 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1344 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 530 aa  74.7  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.51 
 
 		 1535 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.25 
 
 		 1242 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1279 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  32.48 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.9 
 
 		 1759 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  33.64 
 
 		 277 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  38.98 
 
 		 518 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 835 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 641 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.33 
 
 		 582 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.91 
 
 		 1303 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1406 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  36.36 
 
 		 537 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 703 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.38 
 
 		 2031 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  32.52 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  39.62 
 
 		 454 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  29.69 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2216  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.641494  normal  0.0180318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  34.78 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  31.62 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  35.88 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>