More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5338 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  67.88 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  68.61 
 
 
152 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  67.91 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  67.16 
 
 
158 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  63.97 
 
 
182 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  56.94 
 
 
149 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  56.94 
 
 
149 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  56.94 
 
 
149 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  65.91 
 
 
159 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  65.15 
 
 
159 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  65.15 
 
 
159 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  50.96 
 
 
547 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
1185 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
157 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
866 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
641 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
657 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  48.08 
 
 
518 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
776 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.79 
 
 
1218 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
835 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
776 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1406 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
1287 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
1344 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
572 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
592 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 
1088 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.95 
 
 
1303 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
664 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.53 
 
 
1233 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
1279 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
657 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
1222 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.48 
 
 
1242 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
659 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
917 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 
869 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.13 
 
 
1152 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.67 
 
 
582 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.23 
 
 
1535 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  39.5 
 
 
659 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  40 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
702 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
764 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  35 
 
 
584 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.84 
 
 
1453 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  39.02 
 
 
537 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 
277 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
585 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  46.59 
 
 
524 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
568 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1287 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  39.47 
 
 
554 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
530 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.6 
 
 
1759 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0713  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.454574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
530 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
906 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.12 
 
 
1348 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  33.88 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
702 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
569 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1261 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1223 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  34.96 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1331 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
529 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
528 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
526 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  43.27 
 
 
755 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
623 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
930 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  28.21 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
539 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
660 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.26 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  35.9 
 
 
461 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  41.23 
 
 
519 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
540 aa  75.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
760 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4393  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  43.56 
 
 
702 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
528 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
776 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35 
 
 
2468 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>