More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1316 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  90.07 
 
 		 152 aa  276  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  66.2 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  66.2 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  66.2 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  69.17 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  69.92 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  66.91 
 
 		 182 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  68.61 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  66.17 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  65.41 
 
 		 159 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  65.41 
 
 		 159 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 776 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 776 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  41.86 
 
 		 547 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.34 
 
 		 1303 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 866 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1406 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1344 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 572 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 917 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  40.62 
 
 		 519 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 1088 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1287 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 		 869 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1185 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 664 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  39.2 
 
 		 584 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.64 
 
 		 1233 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 592 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.76 
 
 		 582 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.5 
 
 		 1218 aa  80.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 569 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 835 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  36.84 
 
 		 1414 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  44.32 
 
 		 524 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 764 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 657 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  45.19 
 
 		 518 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 702 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 568 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 845 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  32.9 
 
 		 554 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 906 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 585 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1222 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.97 
 
 		 659 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.01 
 
 		 1242 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 657 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  43.69 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 623 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 659 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 240 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.33 
 
 		 1152 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 641 aa  73.6  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 1279 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.38 
 
 		 755 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 760 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 653 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 238 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 794 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 406 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.84 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  37.88 
 
 		 537 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 243 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 794 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  35.4 
 
 		 742 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 730 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  39.09 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 702 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 639 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>