More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5630 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  100 
 
 
158 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  98.1 
 
 
158 aa  303  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  86.3 
 
 
182 aa  244  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  81.13 
 
 
159 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  80.89 
 
 
159 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  80.89 
 
 
159 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  69.72 
 
 
149 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  69.72 
 
 
149 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  69.72 
 
 
149 aa  201  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  67.67 
 
 
152 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  69.17 
 
 
152 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  67.91 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
776 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  41.18 
 
 
547 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
776 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
657 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
1185 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1406 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
917 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
664 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
906 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
866 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  46.3 
 
 
1233 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
835 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
657 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  48.08 
 
 
518 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1287 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  40.52 
 
 
554 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1344 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.74 
 
 
1242 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
702 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
568 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
569 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1088 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.1 
 
 
1303 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
529 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.62 
 
 
1218 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
1279 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
539 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
1331 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
526 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
702 aa  80.5  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.46 
 
 
1152 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  42.11 
 
 
537 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
572 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
623 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
764 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  33.85 
 
 
659 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
776 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
391 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
641 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
391 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
659 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.01 
 
 
2031 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1222 aa  77.8  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.84 
 
 
1535 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
639 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  42.57 
 
 
702 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
397 aa  77.4  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1261 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
653 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
755 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1084 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  32.23 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
869 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
708 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  46.6 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 
522 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
633 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  32.23 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
760 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
530 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
585 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  38.41 
 
 
519 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
930 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  40 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
528 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1223 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
938 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  32.46 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  30.36 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  36.45 
 
 
742 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
701 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>