More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5463 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  100 
 
 
182 aa  346  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  87.67 
 
 
158 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  86.3 
 
 
158 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  81.69 
 
 
159 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  80.28 
 
 
159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  80.28 
 
 
159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  74.81 
 
 
149 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  74.81 
 
 
149 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  74.81 
 
 
149 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  66.19 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  66.91 
 
 
152 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  64.93 
 
 
147 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  40 
 
 
547 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
657 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1185 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
1406 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
917 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
657 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
776 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  44.19 
 
 
157 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 
702 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
776 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
664 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  40.87 
 
 
554 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
866 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
623 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.39 
 
 
1303 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1344 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
764 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.6 
 
 
1152 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.31 
 
 
1242 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
835 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.53 
 
 
1233 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 
1088 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
702 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
1279 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
659 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  43.24 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  40.68 
 
 
659 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
529 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1222 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
568 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  46.73 
 
 
518 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
569 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  44.55 
 
 
702 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
641 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
930 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
938 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.79 
 
 
1218 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
526 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1287 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
906 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
776 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1223 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.36 
 
 
2468 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
760 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  32.14 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.61 
 
 
1956 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
730 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  39.83 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.19 
 
 
2031 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  37.38 
 
 
742 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  33.64 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1084 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
639 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
530 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 
869 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  43.59 
 
 
551 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  28.24 
 
 
228 aa  72  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  32.73 
 
 
121 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.17 
 
 
1535 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
663 aa  72  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
522 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.07 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
708 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1287 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  34.86 
 
 
121 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.96 
 
 
1759 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  44.76 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  33.03 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
633 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
1888 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
755 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
530 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  32.43 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  32.43 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  35.58 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  38.32 
 
 
755 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  36.27 
 
 
524 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>