More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5291 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5291  response regulator receiver protein  100 
 
 		 152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1316  response regulator receiver domain-containing protein  90.07 
 
 		 152 aa  276  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0622647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3142  response regulator  67.59 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1362  CheY-like domain-containing protein  67.59 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.517477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3013  response regulator receiver  67.59 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.174134  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6378  response regulator receiver protein  68.42 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545178  normal  0.378734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5630  response regulator receiver protein  67.67 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal  0.0327485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5463  response regulator receiver protein  66.19 
 
 		 182 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5338  response regulator receiver protein  67.88 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890396  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6058  response regulator receiver protein  66.92 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68971  normal  0.260625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1363  response regulator receiver protein  66.17 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79644  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6466  response regulator receiver protein  66.17 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0540776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 776 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 776 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  42.62 
 
 		 547 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3992  response regulator receiver protein  44 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 866 aa  90.5  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  40.34 
 
 		 1303 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 835 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1406 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 917 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 702 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 1088 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1344 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1185 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 572 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1287 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1222 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  41.59 
 
 		 584 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.17 
 
 		 1218 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.48 
 
 		 582 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 623 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 		 659 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  40.34 
 
 		 659 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 664 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  45.19 
 
 		 518 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 702 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  40.34 
 
 		 519 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 657 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 		 869 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.45 
 
 		 1242 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.96 
 
 		 1152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  38.76 
 
 		 537 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 568 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  46.53 
 
 		 702 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.26 
 
 		 1233 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  31.58 
 
 		 1414 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  43.18 
 
 		 524 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 569 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 1279 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 592 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.13 
 
 		 1535 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  37.39 
 
 		 554 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 760 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 585 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 764 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 845 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 906 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1261 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 730 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 406 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  36.28 
 
 		 742 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 657 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  34.71 
 
 		 457 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 457 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  37.29 
 
 		 1015 aa  74.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 738 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 930 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1303 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.22 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  36.36 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.38 
 
 		 755 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  39.81 
 
 		 741 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 663 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 844 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.56 
 
 		 2468 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0320  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>