More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5252 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  70.88 
 
 		 569 aa  731    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  71.37 
 
 		 569 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  69.73 
 
 		 538 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  57.17 
 
 		 540 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  46.78 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  43.8 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.1 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.1 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  41.75 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  43.52 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  43.46 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 552 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  40.46 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  41.67 
 
 		 532 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 		 532 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  41.07 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  41.65 
 
 		 529 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  40.12 
 
 		 522 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  42.26 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 531 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 		 536 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  37.84 
 
 		 523 aa  329  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  37.62 
 
 		 550 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 528 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  40.97 
 
 		 539 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  38.49 
 
 		 525 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.12 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  40.42 
 
 		 534 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 		 532 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  39.92 
 
 		 527 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  37.76 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  39.26 
 
 		 531 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  39.22 
 
 		 625 aa  296  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  39.06 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  38.07 
 
 		 532 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.22 
 
 		 541 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  36.77 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  37.24 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  33.96 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  35.76 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  34.07 
 
 		 564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  37.15 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.27 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 570 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 570 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 570 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  36.65 
 
 		 527 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  36.64 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  36.64 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.02 
 
 		 563 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 		 563 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  36.45 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 568 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.7 
 
 		 570 aa  246  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.46 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  37.24 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 570 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 		 634 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.1 
 
 		 546 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.89 
 
 		 545 aa  243  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.15 
 
 		 570 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  34.78 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  32.96 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  38.9 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  33.33 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.86 
 
 		 543 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 		 539 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  34.83 
 
 		 525 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  35.16 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  37.09 
 
 		 562 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  35.34 
 
 		 525 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  34.69 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  34.99 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.79 
 
 		 527 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.59 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  36.38 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.7 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  32.66 
 
 		 589 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>