More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2054 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  65.84 
 
 		 550 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  72.47 
 
 		 525 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1087    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  56.43 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  51.84 
 
 		 522 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  50.19 
 
 		 533 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  48.19 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  47.04 
 
 		 529 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  48.64 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.34 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  47.61 
 
 		 532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  47.46 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  47.32 
 
 		 528 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  47.96 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  47.01 
 
 		 550 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 		 527 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  48.28 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  46.62 
 
 		 543 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  47.5 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  46.3 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  46.95 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  45.26 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  45.88 
 
 		 531 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 		 532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  46.38 
 
 		 531 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  45.88 
 
 		 625 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.37 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.37 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  41.75 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  38.49 
 
 		 569 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 528 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  36.85 
 
 		 513 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 524 aa  309  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  32.36 
 
 		 529 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 		 533 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  32.83 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  31.13 
 
 		 533 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  32.29 
 
 		 549 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  33.85 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  32.83 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  31.94 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.44 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.63 
 
 		 568 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  32.21 
 
 		 634 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 		 546 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  32.28 
 
 		 545 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 		 531 aa  217  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  32.28 
 
 		 570 aa  217  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  31.95 
 
 		 557 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  32.46 
 
 		 538 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 		 557 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 		 557 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.54 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  32.1 
 
 		 570 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  32.76 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  32.16 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  32.1 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.96 
 
 		 539 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 		 534 aa  213  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.71 
 
 		 539 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  31.68 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  31.81 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  33.27 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  32.19 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  32.52 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  32.52 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.27 
 
 		 527 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.18 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  32.52 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  31.63 
 
 		 542 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 		 537 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  32.49 
 
 		 562 aa  210  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  30.99 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31.18 
 
 		 570 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  31.08 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  31 
 
 		 570 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 590 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.18 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.31 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  31.99 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.19 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.98 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.53 
 
 		 561 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  30.84 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  32.45 
 
 		 540 aa  207  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 		 522 aa  206  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.59 
 
 		 563 aa  206  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>