More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1030 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  73.36 
 
 		 550 aa  782    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 625 aa  1254    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  94.35 
 
 		 531 aa  963    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  99.44 
 
 		 531 aa  1062    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  74.06 
 
 		 532 aa  750    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  84.4 
 
 		 532 aa  904    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  57.28 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  54.81 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.85 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  53.27 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  50.87 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  51.93 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  50.77 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  52.26 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  48.85 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  51.74 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  49.9 
 
 		 529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 		 532 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  50.57 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.69 
 
 		 532 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  46.48 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  47.71 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  48.61 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  45.79 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  44.72 
 
 		 523 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  43.82 
 
 		 531 aa  399  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  44.4 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  43.81 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  42.78 
 
 		 522 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.56 
 
 		 553 aa  354  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.27 
 
 		 569 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 540 aa  326  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.76 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  40.34 
 
 		 569 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 		 552 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  37.9 
 
 		 524 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 		 526 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.87 
 
 		 545 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.5 
 
 		 545 aa  267  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 		 537 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  38.3 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.22 
 
 		 542 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.22 
 
 		 542 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 568 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.1 
 
 		 513 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  37.8 
 
 		 634 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.32 
 
 		 541 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.64 
 
 		 557 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.64 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.64 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  37.89 
 
 		 543 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  38.49 
 
 		 546 aa  257  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  37.89 
 
 		 545 aa  257  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.9 
 
 		 563 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.44 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  34.54 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  38.37 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.64 
 
 		 529 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  34.34 
 
 		 534 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  34.26 
 
 		 545 aa  249  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 546 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  37.31 
 
 		 538 aa  246  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.16 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  35.33 
 
 		 539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  35.93 
 
 		 570 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 563 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 		 570 aa  243  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  36.01 
 
 		 570 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  36.18 
 
 		 552 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  36.01 
 
 		 570 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.32 
 
 		 570 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  32.96 
 
 		 537 aa  240  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.32 
 
 		 570 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 		 590 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.13 
 
 		 570 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  34.53 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  35.57 
 
 		 570 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.78 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  36.07 
 
 		 542 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 536 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  37.57 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  35.61 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.51 
 
 		 525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 		 565 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  35.8 
 
 		 539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>