More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02495 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  100 
 
 
525 aa  1082    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  72.47 
 
 
528 aa  767    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  66.67 
 
 
550 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  55.6 
 
 
523 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  52.7 
 
 
522 aa  521  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  50.58 
 
 
533 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  49.81 
 
 
531 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  47.88 
 
 
539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  49.51 
 
 
528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  47.21 
 
 
529 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  49.42 
 
 
532 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.34 
 
 
530 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  48.17 
 
 
531 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  46.82 
 
 
529 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.74 
 
 
532 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  48.92 
 
 
528 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 
536 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  47 
 
 
543 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  45.75 
 
 
550 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  44.63 
 
 
532 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  45.18 
 
 
532 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  45.72 
 
 
527 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  45.45 
 
 
522 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  47.88 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.94 
 
 
539 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 
531 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.94 
 
 
539 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 
531 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 
625 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  43.13 
 
 
534 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  39.46 
 
 
569 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  39.26 
 
 
569 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  38.88 
 
 
538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 
553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  38.49 
 
 
528 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 
524 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 
540 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  36.96 
 
 
513 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 
552 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
533 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  35.22 
 
 
546 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  34.23 
 
 
541 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 
545 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  33.01 
 
 
533 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
529 aa  230  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
546 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
546 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
546 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  34.09 
 
 
546 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.55 
 
 
512 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 
545 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.13 
 
 
546 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 
634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  33.07 
 
 
549 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.59 
 
 
527 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  33.02 
 
 
541 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
545 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  33.71 
 
 
557 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 
557 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 
557 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 
534 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  34.92 
 
 
534 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 
539 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  34.16 
 
 
543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  33.79 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  32.17 
 
 
525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  32.68 
 
 
526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  33.72 
 
 
531 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  33.59 
 
 
538 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  35.27 
 
 
532 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  31.91 
 
 
535 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  32.77 
 
 
542 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 
538 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.25 
 
 
531 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  32.24 
 
 
561 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  32.49 
 
 
568 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  32.96 
 
 
542 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 
542 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  34.04 
 
 
537 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  31.85 
 
 
537 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  31.66 
 
 
531 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  30.17 
 
 
522 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 
541 aa  203  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  30.99 
 
 
540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 
536 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  30.77 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  29.47 
 
 
528 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  29.15 
 
 
529 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.38 
 
 
593 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.84 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  32.36 
 
 
536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.75 
 
 
590 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.37 
 
 
538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  31.21 
 
 
531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>