More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1970 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  89.22 
 
 		 538 aa  962    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  71.37 
 
 		 528 aa  732    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 569 aa  1142    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  88.22 
 
 		 569 aa  979    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  57.92 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  44.76 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  44.17 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  42.54 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  41.27 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  42.26 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  41.9 
 
 		 531 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 		 529 aa  362  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 		 528 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  43.51 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  41.37 
 
 		 543 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 528 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 		 550 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 		 523 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  41.19 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 532 aa  336  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  39.73 
 
 		 531 aa  335  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  42.11 
 
 		 539 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  39.46 
 
 		 525 aa  329  8e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  41.29 
 
 		 532 aa  329  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 		 527 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.69 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  40.3 
 
 		 534 aa  316  8e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  40.84 
 
 		 532 aa  316  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 		 531 aa  309  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  40.35 
 
 		 531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  40.35 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  38.07 
 
 		 550 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  37.98 
 
 		 532 aa  286  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  36.89 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  37.95 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  37.94 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 		 542 aa  276  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.21 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  37.07 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.27 
 
 		 563 aa  269  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 		 526 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 		 542 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 536 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  35.63 
 
 		 512 aa  259  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  37.27 
 
 		 552 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 		 541 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.85 
 
 		 570 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 579 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 		 563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.63 
 
 		 545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 		 570 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 		 570 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 570 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 570 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  34.34 
 
 		 525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 568 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  34.96 
 
 		 534 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 		 570 aa  253  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  32.89 
 
 		 529 aa  253  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 570 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  32.93 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  29.57 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  30.31 
 
 		 599 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  35.21 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  35.38 
 
 		 539 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 		 535 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  37.03 
 
 		 525 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  34.57 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  37.69 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  31.78 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  30.73 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  32.01 
 
 		 594 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 		 539 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  35.95 
 
 		 533 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  38.17 
 
 		 562 aa  246  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.49 
 
 		 557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  33.96 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  31.5 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 		 545 aa  243  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  34.49 
 
 		 531 aa  243  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  35.42 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  29.95 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  29.95 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.98 
 
 		 561 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>