More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3118 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 539 aa  1061    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  56.22 
 
 		 530 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  55.35 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  53.93 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.69 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  50.28 
 
 		 531 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  50.92 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  51.7 
 
 		 536 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  51.93 
 
 		 550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  51.2 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 		 528 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  47.88 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  52.13 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  52.3 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  51.55 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  51.03 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  51.2 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.5 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  46.38 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  49.07 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  47.97 
 
 		 531 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  48.94 
 
 		 625 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  48.74 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  45.86 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  47.2 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  47.2 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.21 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  44.58 
 
 		 552 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  42.11 
 
 		 569 aa  346  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  40.9 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  41.53 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  39.7 
 
 		 540 aa  329  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  40.71 
 
 		 538 aa  329  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  39.33 
 
 		 513 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  39.09 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  40 
 
 		 568 aa  269  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 		 529 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  38.42 
 
 		 543 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 634 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 557 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 557 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  37.27 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.99 
 
 		 563 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  35.64 
 
 		 545 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.16 
 
 		 512 aa  250  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  35.45 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.73 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  38.02 
 
 		 546 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 		 532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  34.07 
 
 		 541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  36.41 
 
 		 525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  38.63 
 
 		 538 aa  243  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  36.75 
 
 		 536 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  39.66 
 
 		 562 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  38.04 
 
 		 526 aa  243  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  39.07 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 		 546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.6 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.84 
 
 		 542 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 		 542 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.88 
 
 		 541 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  38.16 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  38.72 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  35.61 
 
 		 529 aa  236  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  35.64 
 
 		 539 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 546 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 539 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  38.55 
 
 		 538 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  37.39 
 
 		 546 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  37.39 
 
 		 546 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 531 aa  233  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  35.98 
 
 		 537 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  32.77 
 
 		 561 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  38.12 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  30.09 
 
 		 589 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  35.83 
 
 		 534 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  35.17 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  35.75 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  38.99 
 
 		 542 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 568 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  32.84 
 
 		 530 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  34.38 
 
 		 534 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  30.4 
 
 		 592 aa  223  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  37.24 
 
 		 528 aa  223  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>