More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0905 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
529 aa  1069    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  77.78 
 
 
531 aa  805    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  81.47 
 
 
529 aa  841    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  78.07 
 
 
528 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  72.02 
 
 
528 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  57.87 
 
 
543 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  54.49 
 
 
532 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  56.41 
 
 
522 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  57.46 
 
 
532 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
530 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  51.69 
 
 
527 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  50.19 
 
 
532 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  51.31 
 
 
533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  49.8 
 
 
523 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  46.88 
 
 
531 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  47.25 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  47.04 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  47.57 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  48.69 
 
 
532 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  49.44 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  47.31 
 
 
532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  51.2 
 
 
539 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  46.82 
 
 
525 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  50.2 
 
 
531 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
625 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  48.43 
 
 
531 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  47.92 
 
 
536 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.56 
 
 
522 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  45.06 
 
 
539 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  45.06 
 
 
539 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 
553 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 
569 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 
569 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  42.37 
 
 
538 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  41.65 
 
 
528 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  41.84 
 
 
540 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  43.26 
 
 
552 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
524 aa  330  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  39.06 
 
 
513 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  38.42 
 
 
533 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 
531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  36.21 
 
 
549 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.7 
 
 
533 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  36.9 
 
 
543 aa  250  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 
540 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 
557 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 
557 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  36.19 
 
 
557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  36.99 
 
 
546 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  36.99 
 
 
546 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.8 
 
 
546 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 
557 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 
557 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 
557 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 
557 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
534 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
546 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  34.15 
 
 
541 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  36.89 
 
 
531 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  35.57 
 
 
546 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  34.15 
 
 
541 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.05 
 
 
593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 
542 aa  234  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  33.21 
 
 
512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.96 
 
 
534 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  36.13 
 
 
546 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  35.85 
 
 
552 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.46 
 
 
563 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 
545 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 
573 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.91 
 
 
526 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  35.95 
 
 
539 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  33.46 
 
 
537 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 
545 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 
568 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 
530 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  29.74 
 
 
589 aa  229  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 
634 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
536 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.78 
 
 
538 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  36.56 
 
 
531 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 
538 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  34.83 
 
 
542 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.27 
 
 
527 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  31.45 
 
 
534 aa  228  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  34.83 
 
 
542 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 
531 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  35.25 
 
 
538 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.94 
 
 
546 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.7 
 
 
561 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  32.95 
 
 
529 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 
545 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  34.69 
 
 
536 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  33.08 
 
 
522 aa  223  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.03 
 
 
538 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  34.34 
 
 
529 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.39 
 
 
533 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  34.89 
 
 
562 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  30.13 
 
 
529 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.16 
 
 
570 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>