More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0452 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  66.67 
 
 
525 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
550 aa  1140    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  65.84 
 
 
528 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  54.79 
 
 
523 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  50.96 
 
 
522 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  50.67 
 
 
533 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  50.1 
 
 
531 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  50.39 
 
 
536 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  48.55 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  47.25 
 
 
529 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  47.73 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  46.88 
 
 
532 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  49.71 
 
 
528 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  47.53 
 
 
532 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.75 
 
 
530 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  48.08 
 
 
550 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  45.2 
 
 
543 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  47.88 
 
 
532 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  46.38 
 
 
539 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 
532 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  46.2 
 
 
531 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  44.59 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  46.39 
 
 
625 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  46.2 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  44.89 
 
 
522 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  46.54 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  42.31 
 
 
539 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  42.31 
 
 
539 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 
534 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 
569 aa  349  8e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  38.08 
 
 
569 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 
538 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  37.62 
 
 
528 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.05 
 
 
553 aa  313  5.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 
540 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 
513 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  34.79 
 
 
524 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  38.11 
 
 
552 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  33.7 
 
 
539 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  32.5 
 
 
512 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  33.16 
 
 
546 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 
546 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 
546 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 
533 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 
545 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
546 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  34.51 
 
 
546 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  33.04 
 
 
546 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 
557 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  32.2 
 
 
557 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 
557 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 
534 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  33.01 
 
 
526 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.4 
 
 
545 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
539 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 
529 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 
533 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  32.84 
 
 
562 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  34.51 
 
 
546 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 
634 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
568 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 
545 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  32.26 
 
 
541 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 
532 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 
563 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 
542 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
570 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.99 
 
 
563 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  32.71 
 
 
538 aa  210  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  31.45 
 
 
541 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 
542 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31 
 
 
570 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  30.43 
 
 
568 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
570 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  31.42 
 
 
538 aa  207  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.57 
 
 
545 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  29.56 
 
 
522 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32 
 
 
536 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.81 
 
 
570 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  30.81 
 
 
570 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31 
 
 
570 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 
570 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31 
 
 
570 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.52 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  32.89 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  31.38 
 
 
529 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.93 
 
 
564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.72 
 
 
536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  30.24 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  30.48 
 
 
531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  30.97 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  29.57 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  31.71 
 
 
552 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  30.68 
 
 
528 aa  196  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>