More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3690 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  94.5 
 
 
545 aa  1047    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  99.12 
 
 
570 aa  1164    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  80.36 
 
 
563 aa  924    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  69.78 
 
 
573 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  63.36 
 
 
565 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  80.6 
 
 
564 aa  927    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  94.56 
 
 
570 aa  1097    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  94.74 
 
 
570 aa  1099    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  99.12 
 
 
570 aa  1162    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
570 aa  1172    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  98.95 
 
 
570 aa  1160    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  95.26 
 
 
570 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  82.48 
 
 
568 aa  946    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  70.07 
 
 
563 aa  777    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  58.59 
 
 
579 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  94.74 
 
 
570 aa  1093    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  67.27 
 
 
590 aa  731    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  58.9 
 
 
593 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  48.93 
 
 
565 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  48.83 
 
 
601 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  45.91 
 
 
561 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  44.62 
 
 
534 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  43.96 
 
 
536 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  46.9 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  47.89 
 
 
542 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  43.38 
 
 
534 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  42.47 
 
 
543 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  43.05 
 
 
512 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 
533 aa  398  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.44 
 
 
538 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  41.46 
 
 
537 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  44.04 
 
 
537 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  43.01 
 
 
539 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  42.3 
 
 
529 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  42.86 
 
 
530 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  42.51 
 
 
536 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  44.38 
 
 
533 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.44 
 
 
538 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
526 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  42.88 
 
 
541 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  43.01 
 
 
535 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  43.31 
 
 
568 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  40.81 
 
 
534 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  42.07 
 
 
539 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 
545 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  40.45 
 
 
525 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  42.07 
 
 
538 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 
538 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  43.25 
 
 
549 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  41.71 
 
 
531 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  41.53 
 
 
545 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  42.27 
 
 
541 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  40.62 
 
 
534 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  42.29 
 
 
539 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  43.31 
 
 
542 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
529 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  43.31 
 
 
542 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  41.64 
 
 
545 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  42.17 
 
 
529 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  40.98 
 
 
553 aa  364  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  41.73 
 
 
552 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  40.48 
 
 
543 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
525 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  43.07 
 
 
552 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  43.07 
 
 
532 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  41.8 
 
 
538 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 
531 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  39.34 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  42.22 
 
 
531 aa  356  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  40.65 
 
 
557 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  40.65 
 
 
557 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  38.29 
 
 
606 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  40.51 
 
 
634 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  38.78 
 
 
540 aa  350  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  41.98 
 
 
541 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.85 
 
 
558 aa  349  8e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
522 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  42.15 
 
 
592 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  38 
 
 
541 aa  346  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  39.51 
 
 
525 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  37.5 
 
 
533 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 
531 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  40.76 
 
 
546 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  38.81 
 
 
525 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  41.93 
 
 
562 aa  343  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
525 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 
542 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.16 
 
 
589 aa  340  4e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 
542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  41.59 
 
 
539 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.26 
 
 
527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  39.33 
 
 
525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  39.38 
 
 
546 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  39.86 
 
 
546 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  39.86 
 
 
546 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>