More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2027 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
552 aa  1126    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  46.36 
 
 
553 aa  451  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  44.38 
 
 
539 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  44.38 
 
 
539 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  43.82 
 
 
569 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  42.78 
 
 
532 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 
538 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 
569 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  43.39 
 
 
532 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  43.89 
 
 
593 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 
528 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  45.64 
 
 
539 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  43.02 
 
 
543 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  41.51 
 
 
533 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  43.78 
 
 
532 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  42.31 
 
 
573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  40.95 
 
 
563 aa  355  8.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 
528 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  40 
 
 
540 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  42.72 
 
 
536 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  42.83 
 
 
530 aa  353  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 
531 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  42.8 
 
 
522 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  42.08 
 
 
529 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  41.56 
 
 
531 aa  343  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  41.42 
 
 
528 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
529 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 
527 aa  340  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
534 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  38.73 
 
 
570 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 
568 aa  329  8e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  38.73 
 
 
545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  38.84 
 
 
564 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  40.15 
 
 
532 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  41.65 
 
 
532 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  38.55 
 
 
570 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  41.92 
 
 
528 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  38.55 
 
 
570 aa  326  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  41.73 
 
 
543 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  40.77 
 
 
531 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 
524 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  39.73 
 
 
525 aa  323  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  38.64 
 
 
541 aa  323  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  40.48 
 
 
550 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 
570 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 
565 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 
570 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  38.36 
 
 
570 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  38.36 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  37.64 
 
 
563 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  38 
 
 
570 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 
590 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  40.58 
 
 
531 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  40.58 
 
 
625 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  38.01 
 
 
523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 
545 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.52 
 
 
545 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 
542 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  38.11 
 
 
550 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 
542 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.49 
 
 
538 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  42.41 
 
 
542 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  36.79 
 
 
541 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  37.27 
 
 
535 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  36.43 
 
 
541 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  36.04 
 
 
561 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 
534 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  33.28 
 
 
589 aa  293  6e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  38.24 
 
 
565 aa  293  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.09 
 
 
538 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.76 
 
 
513 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
634 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  36.83 
 
 
545 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  37.86 
 
 
552 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 
534 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  38.48 
 
 
531 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 
526 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  38.36 
 
 
536 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  36.3 
 
 
537 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.62 
 
 
522 aa  287  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  37.46 
 
 
557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  38.06 
 
 
539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.22 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  37.01 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 
542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  37.29 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 
568 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  37.46 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  38.43 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  39.13 
 
 
525 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 
539 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  40.19 
 
 
534 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.69 
 
 
512 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 
539 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>