More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0930 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  74.58 
 
 
531 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  75.95 
 
 
528 aa  789    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  72.02 
 
 
529 aa  727    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  72.97 
 
 
529 aa  739    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
528 aa  1065    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  57.38 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  58.37 
 
 
522 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  56.3 
 
 
532 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  59.78 
 
 
532 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  53.85 
 
 
530 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  53.76 
 
 
533 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  53.93 
 
 
539 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  51.25 
 
 
550 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  51.81 
 
 
532 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 
532 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  49.71 
 
 
550 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  51.7 
 
 
527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  47.73 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  50.98 
 
 
531 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  52.07 
 
 
625 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  51.87 
 
 
531 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  51.34 
 
 
536 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  48.28 
 
 
528 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  49.05 
 
 
532 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  49.61 
 
 
522 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  48.34 
 
 
523 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  48.92 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  50.65 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  46.63 
 
 
539 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  46.63 
 
 
539 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  44.64 
 
 
569 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  44.25 
 
 
538 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
569 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  43.46 
 
 
528 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  42.59 
 
 
553 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 
540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  41.92 
 
 
552 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  38.05 
 
 
524 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 
513 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.36 
 
 
546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35 
 
 
533 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  36.53 
 
 
540 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  36.62 
 
 
557 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
557 aa  246  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 
531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 
538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  35.27 
 
 
542 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
546 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 
546 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 
526 aa  243  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  35.46 
 
 
542 aa  243  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
522 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  33.58 
 
 
541 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.67 
 
 
529 aa  242  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  35.48 
 
 
534 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  36.43 
 
 
546 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  34.62 
 
 
512 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 
546 aa  237  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 
568 aa  237  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  33.65 
 
 
541 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  34.2 
 
 
563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  34.03 
 
 
539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.6 
 
 
593 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  35.54 
 
 
536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  35.92 
 
 
543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 
546 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 
634 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 
545 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  33.96 
 
 
545 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  35.22 
 
 
552 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  37.71 
 
 
562 aa  231  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  36.01 
 
 
539 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  32.18 
 
 
530 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  33.77 
 
 
545 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  33.96 
 
 
537 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 
531 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 
546 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  33.97 
 
 
539 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  34.61 
 
 
549 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
558 aa  226  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  34.78 
 
 
534 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  33.46 
 
 
525 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  34.6 
 
 
531 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 
536 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  36.89 
 
 
528 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  35.09 
 
 
525 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
537 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.77 
 
 
545 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 
534 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.97 
 
 
538 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 
531 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  34.47 
 
 
538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 
525 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>