More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1349 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
528 aa  1051    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  59.17 
 
 
525 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  57.73 
 
 
533 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  57.66 
 
 
525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  53.79 
 
 
534 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  54.17 
 
 
525 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  54.06 
 
 
527 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  52.53 
 
 
531 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  53.86 
 
 
529 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  48.87 
 
 
528 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  48.78 
 
 
529 aa  455  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  48.3 
 
 
528 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  47.55 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.17 
 
 
511 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  48.97 
 
 
527 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  48.78 
 
 
525 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  47.46 
 
 
525 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  50.93 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  46.69 
 
 
522 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  48.12 
 
 
525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  48.12 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  40.6 
 
 
528 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  44.49 
 
 
543 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  44.19 
 
 
536 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 
573 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  42.13 
 
 
593 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  43.29 
 
 
534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  39.15 
 
 
590 aa  342  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  39.7 
 
 
563 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  41.48 
 
 
534 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  42.69 
 
 
526 aa  336  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  41.09 
 
 
529 aa  333  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  38.03 
 
 
565 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
539 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 
542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  37.29 
 
 
545 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  38.52 
 
 
564 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 
542 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 
553 aa  323  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 
570 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  40.92 
 
 
579 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  41.89 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  42.78 
 
 
531 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  37.11 
 
 
570 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  37.11 
 
 
570 aa  319  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  37.11 
 
 
570 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 
570 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  40.38 
 
 
512 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  39.51 
 
 
541 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  38.33 
 
 
563 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 
570 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 
570 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  39.7 
 
 
541 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 
568 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  40.78 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  40.78 
 
 
542 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  41.17 
 
 
531 aa  312  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  41.13 
 
 
538 aa  312  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  38.67 
 
 
537 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  37.55 
 
 
561 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40.84 
 
 
538 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  40.61 
 
 
535 aa  306  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  41.08 
 
 
533 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.76 
 
 
542 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.04 
 
 
540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  40.51 
 
 
557 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40.46 
 
 
538 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 
557 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 
530 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  40.8 
 
 
539 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  42.22 
 
 
542 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.46 
 
 
558 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  43.1 
 
 
562 aa  296  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  40.38 
 
 
568 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  40.86 
 
 
552 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  38 
 
 
529 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  40.11 
 
 
539 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  39.42 
 
 
634 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  38.52 
 
 
545 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  38.95 
 
 
537 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  40 
 
 
546 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  42.35 
 
 
503 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  39.44 
 
 
546 aa  286  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 
546 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  38.69 
 
 
508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  38.49 
 
 
538 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  41.51 
 
 
531 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 
533 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.78 
 
 
545 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>