More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1352 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  82.95 
 
 		 528 aa  887    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  83.52 
 
 		 528 aa  901    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1081    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  82.95 
 
 		 528 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  76.71 
 
 		 511 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  53.31 
 
 		 529 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  51.5 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  48.79 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  51.04 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  51.23 
 
 		 525 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  48.96 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  47.45 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  51.12 
 
 		 536 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  50.66 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  48.4 
 
 		 525 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  48.87 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  48.11 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  47.74 
 
 		 527 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.27 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  47.83 
 
 		 542 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  46.33 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  48.02 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  40.57 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  47.55 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  43.02 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  41.54 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  45.45 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  40.89 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  39.71 
 
 		 593 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  41.89 
 
 		 534 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  38.43 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  38.82 
 
 		 590 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  37.06 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  36.46 
 
 		 545 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  36.13 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  38.91 
 
 		 536 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  38.21 
 
 		 579 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  35.91 
 
 		 570 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  35.91 
 
 		 570 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  36.1 
 
 		 570 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  36.5 
 
 		 563 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  35.91 
 
 		 570 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.81 
 
 		 542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  37.25 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  35.54 
 
 		 570 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  35.54 
 
 		 570 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  37.43 
 
 		 537 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 530 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  35.38 
 
 		 570 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.31 
 
 		 538 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 		 536 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.17 
 
 		 589 aa  317  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  37.55 
 
 		 561 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  38.74 
 
 		 538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.06 
 
 		 545 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  39.47 
 
 		 539 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 529 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.53 
 
 		 541 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  36.69 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  37.22 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  38.26 
 
 		 538 aa  306  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  36.05 
 
 		 565 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  36.04 
 
 		 601 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  35.27 
 
 		 541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.01 
 
 		 512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  36.26 
 
 		 533 aa  303  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 542 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  40.3 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 529 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 		 542 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  38.09 
 
 		 562 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  36.77 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  37.78 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 526 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  37.64 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  35.76 
 
 		 592 aa  296  6e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 		 540 aa  296  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  36.12 
 
 		 533 aa  296  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  35.78 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  35.63 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1758  Gamma-glutamyltransferase  40.22 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427281  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  35.78 
 
 		 541 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  35 
 
 		 537 aa  289  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  39.49 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  35.29 
 
 		 557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  36.62 
 
 		 546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 		 557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 		 557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  36.62 
 
 		 546 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  36.43 
 
 		 546 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  34.93 
 
 		 634 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>