More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2197 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  78.28 
 
 
528 aa  813    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  76.32 
 
 
528 aa  804    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  76.71 
 
 
528 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  78.28 
 
 
528 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
511 aa  1051    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  52.04 
 
 
531 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
529 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  50.1 
 
 
534 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 
533 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  49.9 
 
 
525 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  49.9 
 
 
525 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  47.27 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  50.86 
 
 
536 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  47.17 
 
 
528 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  46.58 
 
 
525 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.4 
 
 
527 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  47.17 
 
 
527 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 
533 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  40.55 
 
 
528 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  47.27 
 
 
529 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  46.5 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  46.3 
 
 
542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  43.86 
 
 
522 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  42.8 
 
 
543 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  44.72 
 
 
542 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  43.95 
 
 
542 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  37.86 
 
 
573 aa  345  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  40.69 
 
 
534 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  38.05 
 
 
563 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  37.82 
 
 
593 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  37.62 
 
 
590 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  35.97 
 
 
568 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  36.19 
 
 
545 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  38.65 
 
 
530 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  36 
 
 
564 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  35.62 
 
 
570 aa  319  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  35.62 
 
 
570 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  35.62 
 
 
570 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  35.43 
 
 
565 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  35.78 
 
 
561 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.22 
 
 
553 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 
579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  37.98 
 
 
542 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 
570 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 
570 aa  312  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  37.79 
 
 
542 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  37.64 
 
 
545 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 
563 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  38.27 
 
 
536 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.67 
 
 
570 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 
570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 
570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  37.34 
 
 
545 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  37.02 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  37.9 
 
 
545 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  36.19 
 
 
534 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  38.74 
 
 
538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  37.83 
 
 
542 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 
538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  36.73 
 
 
535 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  36.75 
 
 
529 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  35.69 
 
 
541 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 
539 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 
589 aa  297  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 
558 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 
565 aa  296  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  38 
 
 
536 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  37.83 
 
 
557 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  37.83 
 
 
557 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  37.83 
 
 
557 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  35.77 
 
 
537 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 
634 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  34.99 
 
 
541 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
531 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.7 
 
 
538 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 
557 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 
557 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 
557 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 
557 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  36.75 
 
 
568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.31 
 
 
538 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  36.2 
 
 
512 aa  289  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  37.72 
 
 
562 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  36.45 
 
 
540 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  35.7 
 
 
601 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  36.06 
 
 
526 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 
539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 
537 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  36.93 
 
 
552 aa  286  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  37.05 
 
 
546 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 
543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1758  Gamma-glutamyltransferase  38.52 
 
 
545 aa  283  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427281  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  35.15 
 
 
533 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  38.72 
 
 
503 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 
541 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  34.36 
 
 
529 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  37.02 
 
 
508 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  37.67 
 
 
542 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  36.85 
 
 
539 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>