More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1254 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  67.03 
 
 		 545 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  64.56 
 
 		 552 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  72.66 
 
 		 539 aa  779    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  71.8 
 
 		 541 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  67.72 
 
 		 542 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  64.09 
 
 		 557 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  65.19 
 
 		 546 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  64.52 
 
 		 634 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  65.38 
 
 		 546 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  65.56 
 
 		 545 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  79.52 
 
 		 552 aa  858    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  65.68 
 
 		 545 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  64.34 
 
 		 546 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  71.35 
 
 		 539 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  70.13 
 
 		 541 aa  762    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  65.75 
 
 		 546 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  64.15 
 
 		 546 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  64.15 
 
 		 546 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  75.79 
 
 		 541 aa  778    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  65.75 
 
 		 546 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 537 aa  1101    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  64.09 
 
 		 557 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  73.98 
 
 		 543 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  67.66 
 
 		 542 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  57.85 
 
 		 512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  53.66 
 
 		 529 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  56.42 
 
 		 526 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  55.12 
 
 		 568 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  54.95 
 
 		 533 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  54 
 
 		 539 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  55.68 
 
 		 538 aa  548  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  52.89 
 
 		 533 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  54.58 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  56.96 
 
 		 531 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  51.47 
 
 		 536 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  52.35 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  52.17 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  49.07 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 532 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  49.08 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  48.98 
 
 		 534 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 538 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  47.01 
 
 		 534 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  49.26 
 
 		 538 aa  458  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  48.42 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  49.45 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  44.94 
 
 		 537 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.74 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.74 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  48.37 
 
 		 531 aa  418  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  44.65 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  45.02 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  44.65 
 
 		 570 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  44.65 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  44.65 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  43.81 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  44.04 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  43.91 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  43.85 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  43.67 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  44.22 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  43.83 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  42.47 
 
 		 579 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  47.05 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  43.11 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  42.62 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  42.52 
 
 		 590 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.3 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  43.74 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 565 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  41.81 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  40.96 
 
 		 540 aa  349  7e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  38.96 
 
 		 601 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  39.74 
 
 		 531 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  37.04 
 
 		 592 aa  342  1e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  41.19 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  38.85 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 558 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  36.55 
 
 		 606 aa  323  7e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.67 
 
 		 542 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 		 525 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  34.83 
 
 		 589 aa  315  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 		 533 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  41.36 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1758  Gamma-glutamyltransferase  40.44 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427281  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.55 
 
 		 527 aa  306  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  36.76 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>