More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0064 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  69.14 
 
 		 542 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  69.07 
 
 		 527 aa  727    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  69.9 
 
 		 525 aa  732    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  68 
 
 		 525 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 		 525 aa  1068    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  60.19 
 
 		 522 aa  623  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  46.87 
 
 		 528 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  48.2 
 
 		 528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  47.45 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  48.48 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  47.45 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  47.74 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.27 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  46.98 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  47.17 
 
 		 525 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  45.71 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  46.31 
 
 		 525 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  47.46 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  45.09 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  44.11 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  45.68 
 
 		 531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  45.39 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  47.95 
 
 		 536 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  44.57 
 
 		 543 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 570 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  40.82 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  41.01 
 
 		 545 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  45.83 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 		 570 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  40.82 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  40.82 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 		 593 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  40.82 
 
 		 570 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  41.47 
 
 		 579 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  41.31 
 
 		 563 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 		 570 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  42.7 
 
 		 573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  41.07 
 
 		 568 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  45.06 
 
 		 542 aa  359  7e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  40.96 
 
 		 590 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 		 565 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  40.6 
 
 		 536 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.25 
 
 		 538 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  37.6 
 
 		 534 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  40.15 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  37.04 
 
 		 565 aa  333  6e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 543 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 		 534 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  37.23 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40.11 
 
 		 538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  40.3 
 
 		 539 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  40.11 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  41.19 
 
 		 537 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 		 534 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  38.73 
 
 		 512 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  37.5 
 
 		 530 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  39.09 
 
 		 533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  38.45 
 
 		 561 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  39.4 
 
 		 541 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  39.62 
 
 		 531 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 		 553 aa  310  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  39.04 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  38.32 
 
 		 542 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  40.39 
 
 		 533 aa  307  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  39.23 
 
 		 545 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  38.84 
 
 		 541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  38.02 
 
 		 592 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  41.37 
 
 		 531 aa  306  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 		 538 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 		 536 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 541 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  36.98 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 558 aa  302  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  36.16 
 
 		 537 aa  302  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  35.08 
 
 		 539 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.1 
 
 		 540 aa  300  4e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  39.59 
 
 		 542 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  39.01 
 
 		 545 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  39.92 
 
 		 539 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 		 589 aa  296  5e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  39.23 
 
 		 542 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  39 
 
 		 557 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  39 
 
 		 557 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  39 
 
 		 557 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  38.92 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  38.48 
 
 		 634 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  39.21 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  37.05 
 
 		 538 aa  289  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  35.93 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  39.59 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>