More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3710 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 525 aa  1054    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  87.81 
 
 		 525 aa  881    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  72.98 
 
 		 533 aa  787    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  59.17 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  55.68 
 
 		 527 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  56.27 
 
 		 525 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  56.36 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  54.43 
 
 		 531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  51.8 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  51.04 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  49.72 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  49.53 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  49.62 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  49.9 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  49.81 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  52.35 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  49.43 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  46.98 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  50.38 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  53.32 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  49.34 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  49.15 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  41.7 
 
 		 528 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  44.09 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  41.73 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  43.98 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  45.23 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  40.78 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  42.29 
 
 		 593 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 		 565 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 563 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 		 564 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  39.51 
 
 		 545 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 		 570 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  39.33 
 
 		 570 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  39.14 
 
 		 570 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  39.14 
 
 		 570 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  39.14 
 
 		 570 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  39.14 
 
 		 570 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  39.14 
 
 		 570 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  41.36 
 
 		 579 aa  349  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  39.14 
 
 		 570 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  42.67 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  42.99 
 
 		 538 aa  346  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  42.42 
 
 		 536 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  44.63 
 
 		 542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  44.78 
 
 		 542 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  42.72 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  42.78 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  41.22 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  39.54 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 		 542 aa  331  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  39.01 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  40.71 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  42.05 
 
 		 538 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  39.06 
 
 		 541 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  40.38 
 
 		 535 aa  322  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  36.77 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  40.67 
 
 		 542 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  37.71 
 
 		 561 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  40.67 
 
 		 542 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  39.22 
 
 		 545 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.49 
 
 		 538 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  36.67 
 
 		 539 aa  317  4e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  39.58 
 
 		 530 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  43.05 
 
 		 503 aa  316  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.67 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  41.35 
 
 		 539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  39.58 
 
 		 512 aa  312  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.21 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  39.41 
 
 		 545 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  38.85 
 
 		 545 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  41.95 
 
 		 538 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  40.19 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0872  gamma-glutamyltransferase  42.97 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0889  gamma-glutamyltransferase  42.97 
 
 		 530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  39.93 
 
 		 557 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  40.98 
 
 		 542 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  39.93 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  39.93 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  39.06 
 
 		 539 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  39.56 
 
 		 634 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  38 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  39.63 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  40.6 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  38.52 
 
 		 533 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 		 541 aa  297  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  36.61 
 
 		 565 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  37.14 
 
 		 601 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  40.87 
 
 		 531 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  40.6 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1758  Gamma-glutamyltransferase  41.87 
 
 		 545 aa  293  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427281  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  42.91 
 
 		 531 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  39.52 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>