More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2904 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
525 aa  1055    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  88.76 
 
 
525 aa  925    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  68.5 
 
 
527 aa  699    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  62.48 
 
 
522 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  68 
 
 
525 aa  730    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  87.81 
 
 
542 aa  919    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  51.61 
 
 
529 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  46.87 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 
531 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  48.41 
 
 
528 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  49.81 
 
 
525 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  48.02 
 
 
528 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  48.4 
 
 
528 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  49.05 
 
 
534 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  49.06 
 
 
525 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  46.7 
 
 
528 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  49.53 
 
 
525 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.28 
 
 
511 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  46.31 
 
 
533 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  48.78 
 
 
528 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  46.5 
 
 
527 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  46.24 
 
 
533 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  48.31 
 
 
529 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  49.25 
 
 
536 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  41.5 
 
 
563 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  45.63 
 
 
543 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  47.35 
 
 
542 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.49 
 
 
542 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  43.09 
 
 
593 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  40.82 
 
 
545 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  41.08 
 
 
590 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
564 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
570 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
570 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 
570 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 
570 aa  350  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
570 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  38.98 
 
 
534 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 
563 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  40.3 
 
 
568 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  41.85 
 
 
536 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
579 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  41.3 
 
 
534 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
573 aa  337  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  38.32 
 
 
565 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 
526 aa  332  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 
535 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
530 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  37.34 
 
 
565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 
553 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  41.33 
 
 
538 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  39.35 
 
 
534 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  40.31 
 
 
512 aa  319  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  40.19 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40.57 
 
 
538 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  39.74 
 
 
533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  40.19 
 
 
561 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  39.51 
 
 
542 aa  312  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  39.43 
 
 
529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  38.69 
 
 
601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  35.16 
 
 
539 aa  310  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  40.89 
 
 
539 aa  309  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 
558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  40.79 
 
 
543 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  38.67 
 
 
545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  39.25 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  39.04 
 
 
545 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.92 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 
538 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  38.49 
 
 
545 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 
539 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  39.49 
 
 
634 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
537 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  38.55 
 
 
541 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  36.79 
 
 
537 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
557 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
557 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  39.29 
 
 
568 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  39.32 
 
 
538 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
557 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
557 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  39.42 
 
 
542 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  39.71 
 
 
557 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  39.71 
 
 
557 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  39.71 
 
 
557 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  39.42 
 
 
542 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  35.84 
 
 
592 aa  294  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  34.55 
 
 
589 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  38.31 
 
 
531 aa  292  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  38.25 
 
 
533 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  41.25 
 
 
531 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1758  Gamma-glutamyltransferase  41.34 
 
 
545 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427281  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  36.61 
 
 
541 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  40.15 
 
 
552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  39.51 
 
 
542 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  39.35 
 
 
539 aa  281  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>