More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1499 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
525 aa  1059    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  88.76 
 
 
525 aa  949    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0071  gamma-glutamyltransferase  68.31 
 
 
527 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  65.21 
 
 
522 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  69.9 
 
 
525 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  98.67 
 
 
542 aa  1047    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  47.63 
 
 
528 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  51.23 
 
 
529 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  49.06 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  49.34 
 
 
525 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4906  gamma-glutamyltransferase  48.21 
 
 
528 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  48.3 
 
 
534 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  48.87 
 
 
525 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4227  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 
528 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1352  gamma-glutamyltransferase  48.02 
 
 
528 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311733  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  49.15 
 
 
525 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4079  gamma-glutamyltransferase  46.9 
 
 
528 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  48.12 
 
 
528 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  46.5 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  45.25 
 
 
533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  46.33 
 
 
527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  48.41 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3783  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 
533 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903346  normal  0.268995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2749  gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 
536 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  42.24 
 
 
563 aa  385  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  43.64 
 
 
593 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  47.06 
 
 
542 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  46.49 
 
 
542 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  43.81 
 
 
543 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  40.82 
 
 
545 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  40.82 
 
 
570 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 
570 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 
570 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  40.45 
 
 
564 aa  349  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  41.84 
 
 
573 aa  349  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 
570 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  40.64 
 
 
570 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  38.93 
 
 
534 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 
563 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  40.07 
 
 
570 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  41.33 
 
 
590 aa  343  5.999999999999999e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  40.48 
 
 
579 aa  342  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  39.93 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 
534 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  42.04 
 
 
536 aa  334  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  41.22 
 
 
526 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  37.94 
 
 
565 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  37.29 
 
 
565 aa  326  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  40.34 
 
 
561 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 
530 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  40 
 
 
538 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  38.94 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  39.48 
 
 
533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 
534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  39.62 
 
 
538 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  39.56 
 
 
553 aa  313  6.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.76 
 
 
558 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  39.74 
 
 
539 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  39.06 
 
 
536 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  39.41 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  34.55 
 
 
589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  34.53 
 
 
539 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  39.66 
 
 
540 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  39.7 
 
 
568 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 
529 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  37.17 
 
 
537 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  38.12 
 
 
512 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  40.34 
 
 
543 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  36.36 
 
 
592 aa  299  7e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  38.03 
 
 
541 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 
545 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 
538 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 
531 aa  296  9e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  37.36 
 
 
529 aa  294  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 
542 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  36.65 
 
 
545 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  36.92 
 
 
541 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  38.38 
 
 
542 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  36.68 
 
 
541 aa  289  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  37.93 
 
 
533 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 
537 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  38.19 
 
 
538 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  36.63 
 
 
545 aa  286  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  41.03 
 
 
538 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  39.51 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  38.92 
 
 
539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  38.57 
 
 
557 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  38.57 
 
 
557 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  38.57 
 
 
557 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  38.57 
 
 
557 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 
557 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 
557 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  38.39 
 
 
557 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  41.4 
 
 
531 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 
539 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 
634 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
541 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>