More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1163 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
529 aa  1088    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  60.46 
 
 
531 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  60.08 
 
 
531 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  56.76 
 
 
526 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  51.78 
 
 
541 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  54.08 
 
 
568 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  53.66 
 
 
537 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  50.66 
 
 
541 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  52.11 
 
 
533 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  52.13 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4564  gamma-glutamyltransferase  52.63 
 
 
543 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00323876  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  51.25 
 
 
533 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  53.89 
 
 
538 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  51.67 
 
 
546 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  52.63 
 
 
539 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  50.28 
 
 
545 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  51.3 
 
 
557 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  51.49 
 
 
557 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  51.86 
 
 
546 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  51.3 
 
 
557 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 
557 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 
557 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 
557 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  51.67 
 
 
634 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  49.35 
 
 
545 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  51.3 
 
 
546 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  51.12 
 
 
546 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 
557 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  51.12 
 
 
546 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  50.47 
 
 
542 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  52.2 
 
 
539 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  50.86 
 
 
539 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  50.84 
 
 
545 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  50.28 
 
 
542 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 
546 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  52.87 
 
 
562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  51.3 
 
 
546 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  50.47 
 
 
549 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3878  gamma-glutamyltransferase 2  50.47 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798637  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  50.09 
 
 
552 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3055  gamma-glutamyltransferase  52.63 
 
 
541 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  52.03 
 
 
529 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  51.34 
 
 
531 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  48.41 
 
 
530 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  49.16 
 
 
536 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  48.59 
 
 
532 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  47.32 
 
 
534 aa  468  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  50.95 
 
 
538 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.64 
 
 
538 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  47.83 
 
 
538 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  44.61 
 
 
534 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  46.44 
 
 
536 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 
534 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0745  gamma-glutamyltranspeptidase  85.29 
 
 
237 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.804652  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  45.12 
 
 
535 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  47.3 
 
 
539 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2624  gamma-glutamyltransferase 2  44.34 
 
 
508 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  43.39 
 
 
537 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  43.63 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  42.25 
 
 
590 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1141  gamma-glutamyltransferase  47.01 
 
 
531 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.228151  normal  0.0306456 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  41.79 
 
 
563 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  42.49 
 
 
570 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  42.12 
 
 
545 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  42.27 
 
 
579 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  41.62 
 
 
543 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  42.67 
 
 
570 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  42.67 
 
 
570 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  42.49 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  42.67 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  40.74 
 
 
565 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  42.3 
 
 
570 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  42.22 
 
 
570 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  41.71 
 
 
573 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  41.74 
 
 
570 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 
564 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  40.32 
 
 
593 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  42.22 
 
 
542 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  42.72 
 
 
542 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 
568 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  39.73 
 
 
561 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  40.19 
 
 
563 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  38.88 
 
 
539 aa  351  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  37.87 
 
 
592 aa  343  4e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 
565 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  38.33 
 
 
601 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  38.88 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 
558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  39.88 
 
 
531 aa  324  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 
542 aa  323  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  38.98 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 
589 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  39.14 
 
 
531 aa  319  6e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  38.76 
 
 
529 aa  319  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  39.54 
 
 
525 aa  319  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  41.09 
 
 
528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2633  gamma-glutamyltransferase 2  35.8 
 
 
528 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  39.32 
 
 
534 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  40.97 
 
 
542 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 
553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>